U Paint Run 3D staze za trčanje morat ćete obojati određenim bojama. Ispred vas na ekranu će biti vidljivi likovi različitih boja, koji će stajati na različitim mjestima. Koristeći upravljačke tipke, pokazat ćete u kojem će se smjeru kretati vaši heroji. Kamo god trčali, cesta će poprimiti istu boju kao i heroj. Čim to učinite, dobit ćete bodove u igrici Paint Run 3D i prijeći ćete na sljedeću razinu igre.