U igri Son Goku Vs Naruto, morat ćete sudjelovati u borbama između plavog i crvenog tima. Odabirom strane sukoba, naći ćete se sa svojim timom u startnom području. Koristeći upravljačke tipke, natjerat ćete svog heroja da se kreće po lokaciji. Čim primijetite neprijatelja, morat ćete ga uhvatiti u nišan i otvoriti vatru da ga ubijete. Preciznim pucanjem uništit ćete svoje protivnike i za to ćete dobiti bodove u igrici Son Goku Vs Naruto.