Zadatak u igri Clone Ball Maze 3D je isporučiti kuglice u spremnik u obliku stošca koji se nalazi na izlazu iz labirinta. Prolazeći kroz labirint, pokušajte povećati broj kuglica uz pomoć posebnih odjeljaka. Ovo je neophodno kako biste prošli kroz zaključana vrata, u kojem slučaju ćete morati žrtvovati loptice koje bi vam trebale biti više nego dovoljne.